孔姓是中華姓氏中歷史極為悠久的一支，其最著名的後裔便是至聖先師孔子。孔氏的起源可以上溯到歷史傳說時期：相傳早在遠古黃帝時代，就已出現孔姓——當時有一位名叫孔甲的史官，曾著有《盤盂》一書。不過，由於孔甲之後缺乏可考的世系資料，這一支並未延續下來。
因此，一般認為孔姓主要源自子姓。而關於子姓之孔的由來，歷來有以下三種說法：
根據宋代《廣韻》記載，契是商族的始祖，為子姓。自契歷經十四代，傳至成湯。成湯推翻夏桀的暴政，建立商朝，定都於亳。成湯是歷史上著名的聖明君主，其子孫中有一支將商族的姓「子」，與成湯名號中的「乙」字組合起來，定為「孔」姓，這便是最早的孔氏。
據唐代林寶《元和姓纂》所載，西周初期，商紂王的庶兄微子啟受封建立宋國，為子姓。微子啟去世後，其弟衍繼位。衍的曾孫玄孫正考父，官居宋國上卿，以謙恭持重著稱。正考父之子名嘉，字孔父，史稱「孔父嘉」。春秋時期，孔父嘉的後代以其字為氏，取「孔」為姓，遂形成這支孔氏。日後移居魯國的這一分支，正是孔子的先祖，也是孔姓中影響最深遠的一脈。
另據《姓考》等書記載，春秋時期還有多支出自不同姓源的孔氏：
綜上所述，孔姓雖然源流眾多，但以出自子姓、發祥於宋國的一支最為興盛，也最具代表性。如今海內外的孔姓族人大多尊奉孔子為先祖，「天下孔姓一家親」更成為孔氏宗族文化中獨特的傳承現象。
